A grade é composta por disciplinas que servem de base às áreas de Citricultura, Fitopatologia e Entomologia agrícola e predominantemente por disciplinas voltadas a divulgação e discussão de resultados e técnicas mais recentes e efetivas sobre o manejo de pragas e doenças dos citros. Além do conteúdo teórico, aulas práticas também fazem parte de algumas disciplinas, oferecidas na sede do Fundecitrus ou fora da instituição.

As aulas são sempre ricas em discussão sobre a aplicação prática do conhecimento. Há troca de experiências e o conteúdo final lecionado é o resultado da interação entre alunos e professores. Por isso, os cursos de Mestrado Profissional e Especialização estão muito próximos da realidade e necessidades do Setor.

Carga horária total para o Mestrado: 720 horas (disciplinas e trabalho de dissertação).
Carga horária total para a Especialização: 360 horas (disciplinas).